法律分析：当事人在取保候审期间发现检察机关存在违法行为时，可以向相关机构举报。举报应当依据法律规定的程序和要求进行。举报人应当提供充分的证据，如果证据不足，举报将可能被驳回。
法律依据：
1.《中华人民共和国刑事诉讼法》第六十五条规定：“检察机关在侦查活动中，必须依法保护公民的合法权益，不得采取非法手段调查取证或者强行调取、扣留、冻结财产。”当事人发现检察机关存在违法行为时，可以向检察机关或者上级检察机关举报；
2.《中华人民共和国检察机关组织法》第五十规定：“对检察机关工作人员违法失职行为和侵害当事人合法权益的行为，当事人、律师和其他组织和个人有权向检察机关或者上级检察机关反映。”当事人可以向检察机关或上级检察机关进行举报；
3.《中华人民共和国》第三十五条规定：“公民有言论、出版、集会、结社、、示威的自由。”当事人可以通过媒体、互联网等途径进行举报和披露。
因此，当事人在取保候审期间发现检察机关存在违法行为时，可以向检察机关、上级检察机关或通过媒体、互联网等途径进行举报，维护自己的合法权益。